C’est la première université fondée en Israël. Elle fut créée en 1914, et démarra son activité en 1928. Il s’agit de la plus grande université d’Israël, aussi bien par sa taille que par son nombre d’étudiants. Albert Einstein fit don à l’Université Hébraïque de tous ses manuscrits avec leurs droits d’auteur.

Après la Guerre d’Indépendance (1948), l’Université du Mount Scopus est restée une enclave juive en territoire arabe. Il était impossible d’y accéder, et par conséquent, les différents départements de l’Université furent transférés dans plusieurs bâtiments de la ville. À cette époque, l’Université de Givat Ram était en cours de construction à l’ouest de Jérusalem. Au bout de dix-neuf ans, à l’issue de la guerre des Six Jours, le campus du Mont Scopus fut libéré. Depuis, les départements de l’Université sont répartis entre les deux campus.

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